Omkostningerne ved CNC-bearbejdning er cirka mellem $25 og $250 i timen. Dette er dog et skøn, ikke et fast beløb. Mange faktorer påvirker bearbejdningsomkostningerne, især ved brug af et CNC-system. Desuden adskiller omkostningerne ved prototyping sig væsentligt fra omkostningerne ved masseproduktion ved hjælp af CNC-værktøjsmaskiner.
Prototyping er typisk lille-batchproduktion, der ofte bruges til prøveudtagning. I dette tilfælde produceres der meget få stykker. Derfor stiger omkostningerne ved CNC-bearbejdning. Den anslåede pris pr. time for prototyping er $45 til $300. Husk, at små-batchproduktion ofte er dyrere for producenterne.
Masseproduktion er dog generelt omkostningseffektivt-. Hvorfor? Fordi producenter bruger det samme bearbejdningsudstyr og -materialer. De behøver ikke at justere maskinerne eller bruge forskellige udstyrskonfigurationer. Producenten sætter maskinen op, placerer materialerne, starter bearbejdningen, og det er det, når produktionen er færdig. Omkostningerne ved CNC-bearbejdning i masseproduktion er lavere, cirka mellem $15 og $175.
Derudover påvirker formen af den nødvendige del også prisen. Forestil dig, at du har brug for en CNC-del med en ekstremt kompleks form. I dette tilfælde vil omkostningerne til CNC-bearbejdning stige. Tilsvarende er bearbejdningsomkostningerne for simple projekter lave. Fremstilling af dele med komplekse former kræver avanceret maskineri og CNC skæreværktøj.

